Д-р Зоя Велкова е завършила Медицински университет-гр. София през 1986г. От 1992г. д-р Велкова има придобита специалност по детски болести, а от 1995г. – по детска ревмокардиология. Има свидетелство за професионална квалификация по здравен мениджмънт
Квалификационни курсове:
Притежава свидетелство за професионална квалификация „ Ехокардиография в детската възраст-фундаментално ниво” от 2009г. на Медицински университет-гр. София. Участвала в квалификационни курсове по сонография на тазобедрена става, трансфонтанелна ехография, УЗД в детска възраст, абдоминална ехография, детска урология, системни заболявания на съединителната тъкан, ЕКГ в детска възраст, ритъмни и проводни нарушения в детска възраст, артериална хипертония в детска възраст, интензивна терапия на сърдечно-съдовите заболявания в детска възраст и др.